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検索結果 50 件

CycPeptMPDB：包括的な環状ペプチド膜透過率データベースの開発

CycPeptMPDB：包括的な環状ペプチド膜透過率データベースの開発
紙文書・図像類
李, 佳男, Li, Jianan, 柳澤, 渓甫, Yanagisawa, Keisuke, 杉田, 昌岳, Sugita, Masatake, 藤江, 拓哉, Fujie, Takuya, 大上, 雅史, Ohue, Masahito, 秋山, 泰, Akiyama, Yutaka情報処理学会2023-06研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-74 38p.1-8
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

フラグメント対の相対位置から検索可能な化合物立体配座データベースの構築

フラグメント対の相対位置から検索可能な化合物立体配座データベースの構築
紙文書・図像類
齋藤, 那哉, Saito, Tomoya, 柳澤, 渓甫, Yanagisawa, Keisuke, 秋山, 泰, Akiyama, Yutaka情報処理学会2023-06研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-74 37p.1-8
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

標的RNAの高次構造予測に基づく低活性ASO候補配列の推測

標的RNAの高次構造予測に基づく低活性ASO候補配列の推測
紙文書・図像類
渡辺, 銀河, Watanabe, Ginga, 柳澤, 渓甫, Yanagisawa, Keisuke, 秋山, 泰, Akiyama, Yutaka情報処理学会2023-06研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-74 36p.1-8
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

親和性閾値を考慮した適用領域による薬剤標的親和性予測

親和性閾値を考慮した適用領域による薬剤標的親和性予測
紙文書・図像類
杉田, 駿也, Sugita, Shunya, 大上, 雅史, Ohue, Masahito情報処理学会2023-03研究報告バイオ情報学（BIO）2023-BIO-73 16p.1-6
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

Enhancing Ligand Property and Activity Prediction and Interpretation Using Multiple Molecular Graph Representations

Enhancing Ligand Property and Activity Prediction and Interpretation Using Multiple Molecular Graph Representations
紙文書・図像類
Kengkanna, Apakorn, 大上, 雅史, Ohue, Masahito情報処理学会2023-03研究報告バイオ情報学（BIO）2023-BIO-73 35p.1-4
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

AlphaFold2を用いた抗体配列設計の評価

AlphaFold2を用いた抗体配列設計の評価
紙文書・図像類
植木, 孝史, Ueki, Takafumi, 大上, 雅史, Ohue, Masahito情報処理学会2023-03研究報告バイオ情報学（BIO）2023-BIO-73 21p.1-4
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

2種類の言語モデルを用いたタンパク質-化合物相互作用予測手法の開発

2種類の言語モデルを用いたタンパク質-化合物相互作用予測手法の開発
紙文書・図像類
古井, 海里, Furui, Kairi, 大上, 雅史, Ohue, Masahito情報処理学会2023-03研究報告バイオ情報学（BIO）2023-BIO-73 19p.1-3
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

分子動力学シミュレーション軌跡データからの環状ペプチドの膜透過性と相関が高い特徴量の抽出

分子動力学シミュレーション軌跡データからの環状ペプチドの膜透過性と相関が高い特徴量の抽出
紙文書・図像類
能祖, 雄大, Noso, Yudai, 杉田, 昌岳, Sugita, Masatake, 藤江, 拓哉, Fujie, Takuya, 柳澤, 渓甫, Yanagisawa, Keisuke, 大上, 雅史, Ohue, Masahito, 秋山, 泰有, AKIYAMA, Hirokuni情報処理学会2022-06研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-70 50p.1-8
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

多様な実験設定におけるランク学習を用いた化合物スクリーニングの性能評価

多様な実験設定におけるランク学習を用いた化合物スクリーニングの性能評価
紙文書・図像類
古井, 海里, Furui, Kairi, 大上, 雅史, Ohue, Masahito情報処理学会2022-06研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-70 49p.1-6
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

物理化学的特性に着目したタンパク質間相互作用阻害候補化合物の生成

物理化学的特性に着目したタンパク質間相互作用阻害候補化合物の生成
紙文書・図像類
兒嶋, 佑季, Kojima, Yuki, 小杉, 孝嗣, Kosugi, Takatsugu, 大上, 雅史, Ohue, Masahito情報処理学会2022-06研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-70 48p.1-6
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

Defecation Prediction System Using Bowl Sound

Defecation Prediction System Using Bowl Sound
紙記事
MARUMOTO, SOKI, KUBO, TAKATOMI, TADA, MAKOTO, IKEDA, KAZUSHIInformation Processing Society of Japan2022-03-03研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-69 9p.1-5
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

新たなデータセットによる長距離フラグメントリンキング手法の再評価

新たなデータセットによる長距離フラグメントリンキング手法の再評価
紙文書・図像類
津嶋, 佑旗, Tsushima, Yuki, 柳澤, 渓甫, Yanagisawa, Keisuke, 大上, 雅史, Ohue, Masahito, 秋山, 泰, Akiyama, Yutaka情報処理学会2022-03研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-69 16p.1-8
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

適用領域を考慮した薬剤標的親和性予測

適用領域を考慮した薬剤標的親和性予測
紙文書・図像類
杉田, 駿也, Sugita, Shunya, 大上, 雅史, Ohue, Masahito情報処理学会2022-03研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-69 4p.1-6
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

結合エネルギーを考慮したゲノムワイドな高速短鎖核酸配列検索手法の開発

結合エネルギーを考慮したゲノムワイドな高速短鎖核酸配列検索手法の開発
紙文書・図像類
山崎, 眞拓, Yamazaki, Mahiro, 伊澤, 和輝, Izawa, Kazuki, 柳澤, 渓甫, Yanagisawa, Keisuke, 大上, 雅史, Ohue, Masahito, 秋山, 泰, Akiyama, Yutaka情報処理学会2022-03研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-69 8p.1-8
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

Gapmer型ASOにおけるオフターゲット効果のリスク評価手法の提案

Gapmer型ASOにおけるオフターゲット効果のリスク評価手法の提案
紙文書・図像類
玉野, 史結, Tamano, Shiyu, 伊澤, 和輝, Izawa, Kazuki, 柳澤, 渓甫, Yanagisawa, Keisuke, 大上, 雅史, Ohue, Masahito, 秋山, 泰, Akiyama, Yutaka情報処理学会2022-03研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-69 7p.1-7
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

フラグメント化された化合物立体構造データベースの構築

フラグメント化された化合物立体構造データベースの構築
紙文書・図像類
稲垣, 雅也, Inagaki, Masaya, 柳澤, 渓甫, Yanagisawa, Keisuke, 大上, 雅史, Ohue, Masahito, 秋山, 泰, Akiyama, Yutaka情報処理学会2022-03研究報告バイオ情報学（BIO）2022-BIO-69 15p.1-8
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

GBDTによる化合物の血液胎盤関門透過性予測

GBDTによる化合物の血液胎盤関門透過性予測
紙記事
大上, 雅史, Ohue, Masahito, 古井, 海里, Furui, Kairi2021-03情報処理学会研究報告2021-BIO-65 No. 8p.1-3
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

標的配列との結合・開放エネルギー推定に基づくアンチセンス核酸の阻害活性モデルの研究

標的配列との結合・開放エネルギー推定に基づくアンチセンス核酸の阻害活性モデルの研究
紙記事
井澤, 和也, Isawa, Kazuya, 柳澤, 渓甫, Yanagisawa, Keisuke, 大上, 雅史, Ohue, Masahito, 秋山, 泰, Akiyama, Yutaka2021-03情報処理学会研究報告2021-BIO-65 No. 7p.1-7
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

二次元分子記述子を用いた機械学習による環状ペプチドの細胞膜透過性予測

二次元分子記述子を用いた機械学習による環状ペプチドの細胞膜透過性予測
紙記事
村田, 翔太朗, Murata, Shotaro, 吉川, 寧, Yoshikawa, Yasushi, 大上, 雅史, Ohue, Masahito, 秋山, 泰, Akiyama, Yutaka情報処理学会2020-03研究報告バイオ情報学（BIO）2020-BIO-61 No. 5p.1-7
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590

マルチノード・マルチGPU上での網羅的なタンパク質間相互作用予測の高速化

マルチノード・マルチGPU上での網羅的なタンパク質間相互作用予測の高速化
紙記事
渡辺, 紘生, Watanabe, Hiroki, 大上, 雅史, Ohue, Masahito, 秋山, 泰, Akiyama, Yutaka情報処理学会2020-03情報処理学会研究報告2020-BIO-61 No. 3p.1-8
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  • 掲載誌（ISSN）2188-8590